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ISSR分子标记鉴定巴马香猪
Species Authentication of Bama Miniature Pig through Inter-simple Sequence Repeat
金玉兰1, 李婉丽2, 李松2, 李玺洋2, 杨阳2, 陈秋虹3, 孙群2*
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DOI:
作者单位:1. 四川大学轻纺与食品学院, 成都 610064;
2. 四川大学生命科学学院, 生物资源与生态环境教育部重点实验室, 成都 610064;
3. 广西壮族自治区分析测试研究中心, 南宁 530022
中文关键字:巴马香猪;鉴定;线粒体基因;ISSR
英文关键字:Bama miniature pig; identification; mitochondrial gene; inter-simple sequence repeat (ISSR)
中文摘要:结合线粒体基因和ISSR两种DNA分子标记技术对巴马香猪、环江香猪、藏猪、巴马本地土猪和成华猪进行种类鉴定。研究从55条ISSR引物中筛选出1条带型清晰、重复性好的引物53可以鉴别巴马香猪、环江香猪、藏猪、巴马本地土猪和成华猪。巴马香猪与藏猪线粒体基因分析结果表明,藏猪具有特异的短串联重复片段“TGTGTACGCA”,可用于进一步鉴别巴马香猪与藏猪。ISSR分子标记与聚类分析结果显示,引物53可以鉴别5种猪并成功鉴定了一份未知种类的巴马产猪肉样品。结果表明,ISSR分子标记与线粒体基因联合分析可以快速准确鉴别巴马香猪、环江香猪、藏猪、巴马本地土猪和成华猪。
英文摘要:In this study, species identification of Bama miniature pig was carried out by DNA fingerprinting of meats from Tibetan pig, Huanjiang miniature pig, Bama native pig, and Chenghua pig through inter-simple sequence repeat (ISSR) and mitochondrial DNA (mtDNA) analysis. One clear and repeatable primer pair named No. 53 was selected from 55 primers, which successfully separated Bama miniature pig from the other four pigs. To further differentiate Bama miniature pig and Tibetan pig, specific tandem repeat sequence of Tibetan pig ‘TGTGTACGCA’ was found out in the mtDNA. According to the results of ISSR and UPGMA cluster analysis, primer No. 53 was able to attribute to the identification of the five different pigs and one unknown pig. Therefore, ISSR coupled with UPGMA and mtDNA analysis represented an effective tool in species identification.
2016,35(4): 569-573 收稿日期:2016-01-11
DOI:10.11984/j.issn.1000-7083.20160017
分类号:Q959.8;Q78
基金项目:广西科学研究与技术开发计划项目(12118011-2B)
作者简介:金玉兰(1992-),硕士,主要研究领域为食品科学,E-mail:jin199271@126.com
*通讯作者:孙群,女,教授,博士,研究方向为食品安全,E-mail:qunsun@scu.edu.cn
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