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缅甸蟒线粒体基因组全序列测定与分析
Complete Mitochondrial Genome Sequence and Analysis of the Burmese Python Python bivittatus
刘雅芳1,曹婷3,刘建才4,于萍1,赵春萍1,侯冠彧3,张立岭1,2*
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DOI:
作者单位:(1.海南大学农学院动物科学系,海口570228;2. 海南东盛弘蟒业科技股份有限公司,海口571100;3. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室,海南儋州571737;4. 海南甘什岭省级自然保护区,海南三亚572000)
中文关键字:缅甸蟒;线粒体基因组;氨基酸;控制区
英文关键字:Python bivittatus; mitochondrial genome; amino acids; control region
中文摘要:采用LA-PCR (long and accurate PCR)、巢式PCRTA克隆测序技术,首次获得缅甸蟒Python bivittatus线粒体基因组全序列(GenBank登录号NC_021479)。分析结果表明:缅甸蟒线粒体全长17 617 bp,与其它多数蛇类线粒体基因组结构相似,由13个蛋白编码区、2rRNA22tRNA和双控区组成,基因间排列紧凑;与蟒属其它物种相比,缅甸蟒线粒体在氨基酸数目上存在增减现象;tRNAtRNA-Cys长度最短,只有57 bp,二氢尿嘧啶环无配对的茎区;缅甸蟒在两个控制区各存在3个相同的串联重复,可能是造成个体间相差87~89 bp的原因。
英文摘要:The complete mitochondrial genome sequence of Burmese Python (Python bivittatus) was reported and analyzed in this study. LA-PCR (long and accurate PCR), nested PCR and TA-cloning methods were used to map the mitochondrial sequence (GenBank accession number NC_021479). The results showed that the mitochondrial sequence of P. bivittatus was 17617bp in length, which was relatively similar to the mitochondrial genome of other snakes, containing 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes and 22 tRNA genes compactly arranged in the genome. However, there were some differences in the number of amino acids compared with other Python species. The length of the tRNA-Cys was the shortest in 22 tRNAs with no matched base pairs in dihydrouracil loop. And 3 repeat regions were found in the duplicated control regions. These might provide an explanation for why there were 87~89 bp differences among individuals.
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