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白腹鹭CO1和CYTB基因序列分析及鹭属系统发育研究
Gene sequence of COI and Cytb of White-bellied Heron and Molecular Phylogenetic Analysis of Ardea Genus
陈熙 王斌 罗旭
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DOI:
作者单位:西南林业大学
中文关键字:白腹鹭;COI基因;Cytb基因;系统发育树
英文关键字:Ardea insignis;CO1 gene;Cytb gene;Phylogenetic tree
中文摘要:白腹鹭Ardea insignis隶属于鹭科Ardeidae,鹭属Ardea,数量稀少,被IUCN列为极危物种,关于该物种的生态信息和分子生物学研究极少。本研究通过扩增得到了白腹鹭的2个线粒体基因序列(CO1和Cytb),白腹鹭Cytb序列中的嘧啶(39.7%)明显低于嘌呤含量(60.3%),第三位点上碱基偏倚最为突出;CO1基因序列嘧啶(57.2%)明显高于嘌呤含量(42.8%),碱基偏倚同样在第三位点最明显。结合来自Genebank的鹭属其他6种的CO1和Cytb基因序列,构建鹭属的系统发育树,结果表明鹭属7种鸟类构成单系,后验概率支持度为96%,大白鹭和白腹鹭在鹭属中是较早分化出的类群,位于鹭属分支的根部;白腹鹭与草鹭遗传距离最近。
英文摘要:The Ardea insignis is a rare species and the IUCN lists it as a critically endangered species. It belongs to the genus Ardea in the family Ardeidae. There are very few studies carried on this species. We obtained CO1 and Cytb gene sequences of Ardea insignis using PCR technology. The length of the Cytb gene was 1163 bp, content of A + T ( 51. 7%) was higher than that of C + G ( 48. 3%). The length of the CO1 gene was 724 bp,content of A + T ( 52. 7%) was higher than that of C + G ( 47. 5%). Base bias was the most remarkable in the third site of both genes. Combined with the sequences of the other 6 Ardea species form Genebank, we constructed phylogenetic tree of Ardea genus. The result showed that the 7 species of Ardea formed a monophyletic clade, with the posterior support at 96%. A. alba and A. insignis were at the basal of this clade, indicating their early diverge. Based on the genetic analysis, A. purpurea was the most closely related species to A. insignis.
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